2万年间，长期占领地球的怪兽哥斯拉与人类展开生死一战。哥斯拉与特种部队的空中战、轰炸战的场景一一公开。在与 哥斯拉长达半个世纪的战争后，人类败下阵来并计划逃离地球。2048年，在政府通过人工智能选出实验者乘坐太空船移民到其他恒星。20年前父母被哥斯拉杀害的青年Haruo重返地球，带着仇恨的烈焰说出：“我不会放过那家伙（哥斯拉）的。”面对主宰世界长达2万年的哥斯拉，Haruo坚毅的表情极具震撼力。