《邻座的怪同学》由一个既没有朋友，也没有谈过恋爱的冷漠高中女学霸水谷雫（土屋太凤饰）为主线，在一次偶然情况下她被邻座的问题少年吉田春（菅田将晖饰）告白，他们一起经历了第一个朋友、第一次恋爱、第一次接吻、第一次吵架，第一次被卷入三角关系……而两人的周围也逐渐聚拢了一群直爽却又笨拙的朋友，他们将一起讲述一个属于你我的青春校园故事。