不明的病毒袭击了泰国的一个小村子，只有一名小男孩BOY未被感染并被F救出而幸存。原来是‘蓝船（The Blue Ship）’的环保组织研究病毒准备毁灭大部分人类。同时，为了与夜神月决战而在死亡笔记上写下了自己名字的L，设定自己会在23天后在睡梦中安详地死。L、BOY、FBI探员骏河秀明和二阶堂真希必须在23内解决以久条希实子为首的环境恐怖分子……