2388年，在人类对自然资源的疯狂开采及环境污染下，地球变得无法居住，人类被迫移居到巨大的人造诺亚方舟“地球四号空间站”上艰难度日，希望能找到新的家园。马洛中尉因在一次与宇宙海盗的战斗中战功赫赫，联盟将他晋升为上尉。英雄库尔兹上校几年前带队寻找适合人类居住的新星球，与基地完全失去了联系。联盟派马洛率领精英，乘概念号战舰从哥白尼月球监狱出发，营救库尔兹上校。 　　历经数周漫长奔波搜索无果，行进路上还出现了无法预知的宇宙黑洞，导致营救队伍出现了反抗的声音，有人伺机篡位并返航。马洛中尉在坚定信念及拥护者的支持下，终于在黑洞中发现了遇难的飞船，但谁知这并不是库尔兹的驾乘，等待他们的是待机已久数量众多的冷血异形。遭到埋伏的概念号还遇到了宇宙风暴，在与异形浴血搏斗的过程中，马洛的飞船坠落到未知星球的海滩。在那里等待他们的，是凶暴的土著人、异形人军队、和面目全非的库尔兹船长。自以为逃到世外桃源的马洛一行将面临更严峻的生命威胁及道德考验。